特許が無効になった場合、それは初めから存在しなかったものと見なされます。すなわち通常の民事上の無効と同じことです。 法律上の権原がないにもかかわらず取得した財産は不当利得です。 不当利得は、受益者が善意の場合であっても、利益が現存する限度で返還請求権が認められます。 「対価の内容に不当利得が含まれていても返還請求はいたしません」という契約は（まさか無いと思いますが、仮にあったとしても）無効でしょう。