mono debuggerのWindows portを作ってくれる人をUnity3Dが募集しているようです。誰か挑戦してみませんか? ってかなりハードル高いなこれは…ｗ
http://lists.ximian.com/pipermail/mono-devel-list/2009-February/031103.html
（今のmono debuggerはkernel 2.6以降のNPTLに依存しているので、windowsではどうやっても動かないわけで、そこそこ大がかりな移植作業が必要になるのです。）